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Título : Implementación y optimización de PCR-tr para la detención de Bordetella spp. En muestras de exudado nasofaríngeo negativas a virus respiratorios
Autor(es): Roxana Velázquez Lanuza
Palabras clave: PCR
PCR-tr multiplex
Bordetella pertussis
Fecha de publicación : ago-2015
Editorial : Universidad Autónoma de Querétaro
Facultad: Facultad de Ingeniería
Programa académico: Maestría en Ingeniería de Calidad y Productividad
Resumen: La Bordetella pertussis es la bacteria responsable de la tos ferina, enfermedad altamente contagiosa del tracto respiratorio humano, cuya tasa de contagio es mayor a 90 % entre los individuos susceptibles, esta enfermedad también puede ser causada por otras especies de Bordetella (parapertussis y holmesii), aunque con mucho menor frecuencia. Tos ferina es una de las principales causas de mortalidad infantil siendo ésta una enfermedad prevenible por vacunación. Aunque la vacunación ha reducido ampliamente la morbilidad y la mortalidad, una reaparición de esta enfermedad ha sido experimentada en todo el mundo, en las últimas dos décadas. De aquí surge la necesidad de implementar métodos más oportunos para su diagnóstico. En el LESPEQ se realiza la búsqueda de Bordetella pertussis por el método de cultivo que tarda en emitir un resultado hasta 10 días, con el presente trabajo se validó e implementó la técnica de PCR-tr multiplex para dar un diagnóstico en un día y con mayor sensibilidad. Para implementar el método (con los primers y sondas IS481 y ptx1S), se buscó el modelo de la ecuación, el límite de detección, el límite de cuantificación y un estudio de R&R utilizando la vacuna Diperix (4,800,000 UFC/¿L de Bordetella pertussis ). Una vez implementado el método de PCR-tr multiplex, se realizó una prueba de selectividad y se procesaron muestras procedentes de dos orígenes (con los primers IS481, ptx1S y además hIS1001, pIS1001 y RP): el primer grupo de muestras del departamento de Diagnóstico Molecular, muestras nasofaríngeas que dieron resultado negativo o no a virus respiratorios (138 muestras), encontrando un 2.9 % de positividad a Bordetella pertussis . El otro grupo de muestras provenían del departamento de Microbiología Clínica, ya analizados por cultivo con resultado positivo o no a Bordetella pertussis (46 muestras de casos y 46 muestras de contactos) encontrando en los casos analizados un 47.8 % de positivos comparado con 19.56% positivos en cultivo, de igual forma ocurrió para los contactos 21.7% de positividad en PCR-tr multiplex para Bordetella vs 6.52% en cultivo.
URI: https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/7297
Otros identificadores : 1479 - RI002756.PDF
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