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Título: Genómica comparativa de secuencias de genoma completo del virus de la rabia y cepas vacunales en México
Autor(es): Jacqueline García Cano
Colaborador(es): Isabel Bárcenas Reyes [Director]
Palabras clave: Lyssavirus
Mutaciones
Genomas
Epidemiología molecular
Área: CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA
Fecha de publicación : 7-sep-2026
Editorial : Universidad Autonoma de Querétaro
Páginas: 1 recurso en línea (90 páginas)
Folio RI: CNMAC-279535
Facultad: Facultad de Ciencias Naturales
Programa académico: Maestría en Salud y Producción Animal Sustentable
Resumen: La rabia es una enfermedad zoonótica y letal cuyo agente etiológico es el virus de la rabia (VRAB), afecta a animales de sangre caliente y humanos. Causa alrededor de 60,000 muertes humanas anuales en el mundo. En México, la principal estrategia para la prevención y el control del VRAB es la vacunación en especies ganaderas y especies domésticas como el perro y el gato, normalmente con las cepas vacunales ERA y SAD que provienen de aislamientos virales obtenidos entre 50 y 100 años atrás. El monitoreo molecular del VRAB, se ha basado en el uso de secuencias parciales del genoma (SPG), lo que limita la detección de variantes nucleotídicas dentro de las poblaciones virales, ya que, el poder discriminatorio para la detección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) es menor que cuando se usa la secuencia del genoma completo (SGC) del VRAB y puede revelar potenciales marcadores moleculares determinantes de la antigenicidad entre las cepas vacunales del VRAB y las cepas de campo que respalden el monitoreo de las vacunas antirrábicas y la diversidad genética del VRAB frente a los nuevos brotes de la enfermedad. Se analizaron veintidós SGC-VRAB obtenidas de bases de datos públicas. La identificación de variantes se realizó con Samtools utilizando dos cepas vacunales (ERA y SAD) y una cepa de campo (3634DR) como referencias. La clasificación de los SNP se realizó en RStudio, la predicción de la estructura terciaria de la glicoproteína del VRAB se realizó en Alphafold2 y el análisis estructural en ChimeraX. Como resultados, se identificó un mayor número de SNPs en los ensambles obtenidos con las cepas vacunales. Se caracterizaron los SNPs en SNPscodificantes, SNPs-No/codificantes, SNPs-sinónimos y SNPs-No/sinónimos (SNP-NOSIN) y también se identificaron SNP-NOSIN en el sitio antigénico IV entre las glicoproteínas vacunales y las glicoproteínas de campo del VRAB, las cuales no presentaron alteraciones estructurales globales entre sí.
URI: https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13250
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