1. Repositorio Institucional UAQ
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Título:	Análisis in silico de la secuencia del promotor del gen SMUG1 en pacientes con cáncer de pulmón
Autor(es):	Andrea Alelhí Sosa del Angel
Área:	BIOLOGÍA Y QUÍMICA
Fecha de publicación :	22-may-2025
Editorial :	Universidad Autonoma de Querétaro
Páginas:	1 recurso en línea (99 páginas)
Folio RI:	FQLIN-289643
Facultad:	Facultad de Química
Programa académico:	Químico Farmacéutico Biólogo
Resumen:	La enzima SMUG1 forma parte del mecanismo de Reparación por Escisión de Bases (BER) y escinde uracilo, derivado de la oxidación de timina o de la desaminación de citosina metilada, en el ADN. Diversos estudios sugieren que cambios en el promotor de genes asociados a este mecanismo pueden influir en el riesgo de desarrollar cáncer. Este estudio incluyó a pacientes diagnosticados con cáncer de pulmón de células no pequeñas, específicamente adenocarcinoma en etapa IV, con una edad promedio de 76 años. A partir de muestras de sangre periférica, se llevó a cabo la secuenciación de un fragmento del promotor del gen SMUG1. Posteriormente, se realizó un estudio de docking molecular entre el factor de transcripción YY1 y la secuencia analizada. En un paciente, se identificaron las variantes Chr12:54190744 G/A y Chr12:54190674 G/A, ubicadas en una región reguladora de cromatina abierta, la cual esta silenciada por mecanismos epigenéticos en tejido pulmonar. Aunque no se observaron cambios en la secuencia de unión entre los grupos, el análisis de docking molecular reveló una interacción más fuerte y una mayor energía electrostática entre YY1 y esta región, en comparación con la secuencia cocristalizada previamente reportada para este factor. Dado que no se ha reportado previamente una relación entre YY1 y SMUG1, este hallazgo sugiere que esta región podría funcionar como una zona de unión, y estudios experimentales reportan que esta región regula negativamente la expresión de SMUG1. Se cree que las variantes encontradas podrían ser relevantes debido a su baja frecuencia en la población y su ubicación en el genoma. Además, este proyecto sugiere, por primera vez, la interacción in silico entre el factor YY1 y el promotor de SMUG1 en una región de cromatina abierta. Como perspectiva, se propone recopilar datos sobre la frecuencia del alelo alternativo en la población mexicana, y realizar estudios adicionales que ayuden a comprender el papel de YY1 en la regulación del gen SMUG1.
URI:	https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/11829
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