Ocurrencia, diversidad genética y estabilidad de norovirus en frutas y hortalizas seleccionadas.

Omar Hernández Hernández

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dc.rights.license	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0	es_ES
dc.contributor	Sofía María Arvizu Medrano	es_ES
dc.creator	Omar Hernández Hernández	es_ES
dc.date	2023-01-07
dc.date.accessioned	2023-02-17T16:35:56Z
dc.date.available	2023-02-17T16:35:56Z
dc.date.issued	2023-01-07
dc.identifier.uri	http://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/4396
dc.description	El objetivo del presente estudio es determinar el efecto de los carbohidratos HBGA en la estabilidad de norovirus murino en conjunto con el pH, temperatura, fuerza iónica, y presencia de bacterias en frutas y hortalizas. Se diseñó y válido un procedimiento para la detección múltiple de norovirus murino GV (MNV-1), Salmonella, Shigella y E. coli enterohemorrágica (ECEH) evaluando el efecto de la solución amortiguadora de elución de MNV-1 en la viabilidad bacteriana, el preenriquecimiento simultáneo y la detección simultánea por PCR. La técnica de detección se aplicó a 200 muestras de cilantro, lechuga, fresa y zarzamora y también se cuantificaron las bacterias mesófilas aeróbias (BMA), enterobacterias (EB) y E. coli mediante técnicas de cultivo tradicional. La genotipificación se determinó mediante la herramienta norovirus typing tool secuenciando el ORF2. Se compararon con los genotipos más frecuentes en las bases de datos NoroNet y CalciNet. La estabilidad se evaluó en fresa y lechuga incluyendo la concentración de E. coli O157:H7 (5 Log10 UFC/mL), la temperatura (22 y 4 °C), la fuerza iónica (0.25 mM), el pH (3 a 8) y la presencia de N-acetil glucosamina (1% p / v) con una cepa de MNV-1. El medio seleccionado para el preenriquecimiento de bacterias fue agua peptonada tamponada suplementada con vancomicina (8 ppm), novobiocina (0,55 ppm) y verde brillante (0,2 ppm) e incubación a 41.5 ° C / 24 h. Los productos de PCR fueron secuenciados y los números de acceso son: MW768703 (InvA), MW422896 (IpaH), MW768704 (Stx1) y MW768705 (Stx2). La sensibilidad de la técnica de detección fue de 10 a 100 partículas de MNV-1 y 1 a 10 células de cada bacteria patógena. La población de BMA, EB y E. coli para todas las matrices alimentarias, varió entre 3.18 a 5.67 y 1.8 a 4.3 Log10 UFC/g y <1.8 a 3 NMP/g, respectivamente. Dos muestras de fresa fueron positivas para norovirus GI.1 (MZ224458) y GI.3 (MZ227012) y una muestra de lechuga para ECEH. La mayor presencia de aminoácidos hidrofílicos y ramificados con anillos aromáticos, y menor proporción con cadena lateral corta y capacidad de afectar la estructura secundaria indicaron un incremento en la estabilidad de los virus en general. MNV-1 fue más estable a pH ácido, temperatura de refrigeración y con la presencia de carbohidratos HBGA. E. coli O157:H7 estabilizó a MNV-1 exclusivamente en condiciones básicas.	es_ES
dc.format	Adobe PDF	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Química	es_ES
dc.relation.requires	Si	es_ES
dc.rights	Acceso Abierto	es_ES
dc.subject	Ciencias Agropecuarias y Biotecnología	es_ES
dc.subject	Ciencias de la Vida	es_ES
dc.title	Ocurrencia, diversidad genética y estabilidad de norovirus en frutas y hortalizas seleccionadas.	es_ES
dc.type	Tesis de doctorado	es_ES
dc.creator.tid	CVU	es_ES
dc.contributor.tid	curp	es_ES
dc.creator.identificador	417049	es_ES
dc.contributor.identificador	AIMS720526MMNRDF09	es_ES
dc.contributor.role	Director	es_ES
dc.degree.name	Doctorado en Ciencias de los Alimentos	es_ES
dc.degree.department	Facultad de Química	es_ES
dc.degree.level	Doctorado	es_ES