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Título : Inferencia y comparación entre redes de regulación génica de células provenientes de cáncer endometrial y otros tipos celulares coexistentes en un tumor primario
Autor(es): Jorge Luis Gómez Hernández
Palabras clave: Cáncer endometrial
Enriquecimiento funcional
Heterogeneidad celular
Redes pesada de co-expresión de genes
scRNA-seq
Área: BIOLOGÍA Y QUÍMICA
Fecha de publicación : 1-jun-2024
Editorial : Universidad Autónoma de Querétaro
Páginas: 1 recurso en línea (62 páginas)
Folio RI: CNLIN-279466
Facultad: Facultad de Ciencias Naturales
Programa académico: Licenciatura en Microbiología
Resumen: El cáncer endometrial es una enfermedad multifactorial que afecta principalmente a mujeres de la tercera edad, tanto en México como en el resto del mundo (Bahena-González et al., 2023). Esta enfermedad, al igual que otros tipos de cáncer, se caracteriza por la presencia e interacción entre células cancerígenas y células del propio organismo dentro de un mismo tejido (heterogeneidad tumoral), lo que genera un microambiente tumoral que puede influir la progresión de la enfermedad y su respuesta a distintos tratamientos (Dagogo-Jack & Shaw, 2017; Makker et al., 2021). Considerando estos puntos, el presente trabajo utuliza datos de secuenciación con resolución de una sola célula (scRNA-seq), provenientes de un tumor primario de cáncer endometrial en una mujer de 70 años, con el objetivo de identificar algunos de los posibles agentes genéticos que hacen posible el desarrollo y supervivencia de esta enfermedad. Para ello, se implementaron una serie de análisis bioinformáticos utilizando el lenguaje de programación R (R Core Team, 2024), con el fin de obtener resultados confiables y reproducibles. Entre los procedimientos realizados, se destacan: la identificación de las células cancerígenas y otros tipos celulares presentes en la muestra analizada, la generación de redes pesadas de co-expresión de genes, la identificación de genes asociados con macrófagos y el estado canceroso de las células, el análisis de enriquecimiento funcional de estos genes y la evaluación de las características topológicas de las redes de genes obtenidas. Los resultados obtenidos son consistentes con investigaciones previas. Específicamente, se identificaron genes asociados con mecanismos de biogénesis ribosomal, eventos proliferativos, de aumento en la tasa de traducción proteica y de evasión a la respuesta inmune; lo que se ha descrito con anterioridad en distintos tipos de cáncer.
URI: https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/11040
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