El objetivo de este trabajo es identificar cómo el paradigma de la Nueva Gestión Pública (Aguilar, 2006 [2013])(Arellano & Cabrero, 2005) ha repercutido en la organización, normas y valores de la ciencia y de los investigadores en la Universidad Autónoma de Querétaro, a través de los programas de estímulos SNI, PRODEP y el programa de Estímulo al Desempeño del Personal Docente, que es un programa interno de la universidad. Se recurrió a la teoría de la Sociología de la Ciencia de Robert K. Merton (1974) para analizar el ethos y estructura científicos a partir de los programas de reconocimiento. Para obtener la información se realizaron 51 encuestas basadas en la escala tipo Likert y 23 entrevistas a una muestra de docentes de tres facultades: Psicología, Ciencias Políticas y Sociales e Ingeniería. Los resultados muestran que la actividad científica dentro de la universidad se desarrolla a partir de dos estructuras normativas y de valores que generan condiciones de ambivalencia en los investigadores y repercuten en el desempeño y calidad de sus labores. Estas estructuras y ambivalencia son dos elementos para repensar el cambio institucional en la universidad pública queretana.
The objective of this work is to identify how the paradigm of New Public Management (Aguilar, 2006 [2013])(Arellano & Cabrero, 2005) has affected the organization, norms and values of science and researchers at the Autonomous University of Queretaro, through stimulus programs SNI, PRODEP and Stimulus for Performance of Teachers, which is an internal program of the university. It was used the theory of Sociology of Science of Robert K. Merton (1974) to analyze the scientific ethos and structure from reward programs. The information was based on 51 surveys Likert scale and 23 interviews applied to a population of teachers of three faculties: Psychology, Political and Social Science and Engineering. The results show that scientific activity within the university develops from two normative structures and values that create an ambivalent condition for researchers and affect their performance and quality of their work. These structures and ambivalence are two elements to rethink the institutional change in public university of Querétaro.