El aumento de bacterias resistentes a los antibióticos (BRA) es un problema prioritario reconocido por la Organización Mundial de la Salud (OMS). Desde el contexto de Una Salud representa una de las principales amenazas para la salud humana, animal y ambiental. Desde hace más de 5 años se ha señalado que las BRA podrían ser las causantes de la siguiente gran pandemia. Hasta la actualidad solo  1% de las bacterias han podido ser cultivadas usando métodos cultivo- dependiente. Esta desventaja dificulta considerablemente la detección y cuantificación de BRA prevalente en muestras clínicas y ambientales; principalmente en estudios enfocados a la reducción de BRA. Apoyado en esta premisa, el presente trabajo tiene como objetivo desarrollar una herramienta molecular cultivo- independiente basada en la PCR cuantitativa (qPCR) para determinar la prevalencia y diversidad de genes de resistencia a antibióticos en poblaciones bacterianas en muestras clínicas (excretas) y ambientales (suelo) asociadas a producción animal. Para este fin se identificaron las determinantes genéticas de resistencia a antibióticos (DGRA) de mayor importancia en salud pública y veterinaria (tetM, tetO, tet(W), tetA, tet(Q), blaCTX-M, blaCTX-M15, blaCMY-2, blaTEM, blaSHV, ermB, ermC, sul1, sul2, qnrB, qnrS, aadA), se analizaron 1953 alelos con el objetivo de conocer la variabilidad genética de cada familia identificada y se evaluaron en cuanto a cobertura y especificidad 95 iniciadores de PCR dirigidos a la amplificación de estas DGRA. Se estandarizaron los iniciadores de qPCR previamente evaluados, permitiendo la utilización de esta metodología para el análisis de prevalencia, distribución y abundancia de las DGRA identificadas en este estudio en un total de 80 muestras provenientes de sistemas de producción animal. Se observó una elevada prevalencia de elementos genéticos móviles (intl1) asociados a resistencia a antibióticos (RAM) y genes que confieren resistencia a quinolonas (qnrB: 100%), sulfamida (sul1 y sul2: 99%) y betalactámicos (blaTEM, blaSHV y blaCMY: 92%). El gen intl1 tuvo la mayor abundancia relativa, seguido de sul1, qnrB, sul2, blaSHV, blaCMY y blaTEM. En general en las muestras de suelo se observó una mayor abundancia de genes de resistencia a antibióticos (DGRA) comparado con excretas de sistemas de producción bovino, porcino. En conjunto estos resultados sugieren que las BRA son altamente prevalentes y abundantes en sistemas de producción animal intensiva. Finalmente, el desarrollo e implementación de esta metodología será fundamental para cuantificar, de manera objetiva y precisa DGRA presentes en entornos de producción animal, permitiendo evaluar y comparar prevalencia y diversidad de genes de resistencia a antibióticos de importancia clínica y veterinaria.