Título :	Filogenia y genómica comparativa de cepas de Mycobacterium bovis de México
Autor(es):	Claudia Angélica Perea Razo
Palabras clave:	SNP Mycobacterium bovis tuberculosis bovina secuenciación de genoma completo espoligotipificación
Área:	CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA
Fecha de publicación :	14-jul-2020
Facultad:	Facultad de Ciencias Naturales
Programa académico:	Doctorado en Ciencias Biológicas
Resumen:	Mycobacterium bovis es el agente causal de la tuberculosis bovina y es capaz de infectar una amplia variedad de huéspedes mamíferos incluyendo al humano. En México, la tuberculosis bovina es endémica y representa un importante problema para el sector pecuario, así como para la salud pública. En este estudio se analizaron 320 aislados de M. bovis obtenidos a partir de ganado bovino (cárnico y lechero) y humanos, de distintos estados del país: Baja California, Coahuila, Jalisco, Guanajuato, Aguascalientes, Querétaro, Hidalgo, Estado de México y Veracruz. Se realizó la genotipificación de los aislados mediante espoligotipificación y secuenciación genómica completa para evaluar la diversidad genética con respecto al huésped, fin zoontécnico y región geográfica, con el fin de determinar características genómicas específicas. Se determinaron 39 espoligotipos, los más frecuentes fueron SB0673, SB0971, SB0140 y SB0145; aunque el origen y huésped no influyeron sobre la diversidad genética, las cepas de Baja California obtuvieron perfiles genéticos exclusivos de esa región. A partir de los perfiles de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) se obtuvieron 12 grupos genéticos, los cuales mostraron concordancia en cuanto a las relaciones genéticas obtenidas a partir de la espoligotipificación, validando de esta manera el uso actual de esta técnica frente a las tecnologías más modernas para el monitoreo epidemiológico de la enfermedad. Se observó un pangenoma abierto, con un total de 3,687 genes esenciales. La densidad promedio de SNP fue de 1 por cada 10,850 pares de bases, los cuales principalmente cayeron en regiones río arriba y río abajo de los genes, y en segundo lugar dentro de exones. Así mismo, las mutaciones no sinónimas superaron a las mutaciones sinónimas, en su mayoría con un efecto predicho “moderado” sobre la función proteica. La diversidad genética de M. bovis en México puede deberse a mutaciones puntuales que ha obtenido a través del tiempo y de un evento de transmisión a otro. Es necesario desarrollar y reforzar estrategias que eviten la continua diseminación del microorganismo para impulsar de manera más efectiva los esfuerzos de erradicación.
URI:	http://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/2162
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