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Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.rights.licensehttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0es_ES
dc.contributorEdgardo Ulises Esquivel Naranjoes_ES
dc.creatorJairo Sánchez Floreses_ES
dc.date2021-02-18-
dc.date.accessioned2020-02-17T18:02:41Z-
dc.date.available2020-02-17T18:02:41Z-
dc.date.issued2021-02-18-
dc.identifier.urihttp://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/2060-
dc.descriptionEl hongo Trichoderma atroviride tiene un genoma atractivo para estudiar micoparasitismo, metabolismo y fotomorfogénsesis, debido a sus características biológicas distintivas como capacidad antagonista contra hongos fitopatógenos, amplio repertorio enzimático, conidiación inducida por luz azul y un efecto promotor de crecimiento en plantas. Análisis genómicos han mostrado genes clave para comprender procesos evolutivos, incluyendo micoparasitismo e interacciones recíprocas hongo-planta. Hasta la fecha, se han desarrollado y mejorado diversas herramientas genéticas con el objetivo de descubrir funciones de genes en hongos filamentosos, a pesar de eso la identificación de los genes mutados sigue siendo un cuello de botella en las estrategias de genómica funcional. En este trabajo, desarrollamos una nueva estrategia de mutagénesis, basada en la integración plasmídica por recombinación homóloga, facilitando la identificación de los genes interrumpidos. El plásmido pCB1004 fue utilizado para construir una biblioteca genómica, la cual contenía fragmentos de ADN de T. atroviride con tamaños entre 0.75 y 1.5 kbp. Después de dos pases monospóricos de cepas transformantes en medio selectivo con higromicina B, se realizaron pruebas de estabilidad para el marcador de selección, revelando que 224 de 800 transformantes resultaron estables, sugiriendo la integración del plásmido en el genoma en el 28% de las transformantes. En orden de determinar la identidad de las inserciones del plásmido, se implementó un nuevo enfoque de identificación a través de PCR y secuenciación. Los resultados indicaron que las inserciones ocurrieron mayoritariamente en eventos independientes únicos y dobles, distribuidas al azar a través del genoma de T. atroviride. La caracterización fenotípica de las transformantes a estrés metabólico, daño mecánico y ensayos de fotoinducción permitió determinar funciones génicas previamente no descritas en cepas mutantes con un crecimiento muy reducido (ID proteínas: 52977 unión a metales de transición, 143930 modificación y procesamiento de RNA, 317064 actividad de transporte, 33929 remodelación de la cromatina, 298021 función desconocida y 233373 actividad de transporte) y afectadas en fotoconidiación (48079 péptido sintetasa no ribosomal, 81320 actividad catalítica, 39327 actividad de transporte, 173440 plegamiento de proteínas, 307447 ubiquitina ligasa y factor de corte y empalme del ARNm ). En conjunto, nuestros datos proveen evidencia del potencial promisorio de esta estrategia de mutagénesis, siendo una de sus mejores bondades la rapidez y facilidad para identificar el gen afectado.es_ES
dc.formatAdobe PDFes_ES
dc.language.isoEspañoles_ES
dc.relation.requiresNoes_ES
dc.rightsEn Embargoes_ES
dc.subjectTrichoderma atroviridees_ES
dc.subjectMutagénesis insercionales_ES
dc.subjectRecombinaciónes_ES
dc.subjectHomólogaes_ES
dc.subjectInterrupción de geneses_ES
dc.subject.classificationBIOLOGÍA Y QUÍMICAes_ES
dc.titleMutagénesis insercional mediada por recombinación homóloga en el hongo Trichoderma atroviridees_ES
dc.typeTesis de licenciaturaes_ES
dc.creator.tidCURPes_ES
dc.contributor.tidcurpes_ES
dc.creator.identificadorSAFJ951226HQTNLR14es_ES
dc.contributor.identificadorEUNE710817HMNSRD15es_ES
dc.contributor.roleDirectores_ES
dc.degree.nameLicenciatura en Microbiologíaes_ES
dc.degree.departmentFacultad de Ciencias Naturaleses_ES
dc.degree.levelLicenciaturaes_ES
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