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Title: Genotipificación de aislados de Mycobacterium bovis obtenidos a partir del ganado bovino de México
metadata.dc.creator: ALEJANDRO NAVA VARGAS
Keywords: CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA;CIENCIAS AGRARIAS
metadata.dc.date: Apr-2015
Description: La tuberculosis bovina (TBb) es una enfermedad causada por Mycobacterium bovis que afecta al ganado y otras especies, incluyendo al humano. La TBb es considerada un problema de salud pública, además de que es una barrera no arancelaria para la comercialización del ganado, principalmente con los EU, nuestro principal socio comercial, por lo que México tiene una campaña nacional enfocada a su erradicación. La técnica de VNTR¿s, es una herramienta de biología molecular basada en la PCR útil en el diagnóstico y la genotipificación de M. bovis, identifica de 6 a 24 loci para establecer similitudes genéticas en aislados bacterianos, lo que permite determinar la presencia de M. bovis, así como establecer rutas de diseminación y focos de infección. El objetivo del presente trabajo fue comparar los patrones genéticos entre aislados de M. bovis provenientes del ganado bovino de distintas regiones de México y determinar su distribución geográfica. La PCR se realizó con 12 juegos de iniciadores y los productos fueron sometidos a electroforesis en gel de agarosa al 2% teñido con bromuro de etidio para evaluar el tamaño del producto, el cual indica el número de copias de cada loci que dan origen al VNTR. Los resultados muestran que los 467 aislados obtenidos de muestras de bovinos sospechosos a la infección con M. bovis en diferentes estados de México, se asocian en 13 grupos que comparten el genotipo, mientras que al combinar los patrones VNTR¿s con el espoligotipo se generaron 17 grupos con relación genética. El dendrograma revela que existe tendencia de agrupación por región, al formarse grupos donde se encuentran aislados de un solo estado, integrados por dos estados de la región, sin embargo también se forman grupos con estados de diferentes regiones. El análisis por VNTR¿s revelo un alto poder de discriminación de 0.99. La diversidad alelica obtenida para cada uno de los loci fue desde 0.239 hasta 0.857. El loci que presentó mayor poder de discriminación fue el 2461 (D= 0.857), seguido de 0577 (D= 0.804), mientras que el 2686 (0.239) obtuvo el más bajo.
Bovine tuberculosis (BTb) is a disease caused by Mycobacterium bovis, that affects cattle and other species, including humans. BTb generate large economic losses and is considered a risk to public health; in addition it is a non-tariff barrier to free trade of cattle, mainly with the US, our largest trading partner, so that Mexico has a national campaign aimed to eradication. Is a molecular biology tool in the diagnosis and genotyping of M. bovis. VNTR's, a molecular biology tool based on PCR, identifies 6-24 loci to establish genetic similarities in bacterial isolates, allowing you to identify the presence of M. bovis and establish dissemination routes and sources of infection. The aim of this study was to compare genetic patterns among isolates of M. bovis from cattle from different regions of Mexico to determine their geographical distribution. PCR was performed with 12 sets of primers and the products were ran in 2% agarose gel electrophoresis stained with ethidium bromide to assess product size, which indicates the number of copies of each loci to generate a specific VNTR. The results show that the 467 isolates obtained from samples of suspected cattle to infection with M. bovis in different states of Mexico, were grouped into 13 groups that share the genotype VNTR's while combining the patterns VNTR's with spoligotype, 17 genetically related groups were generated. The dendrogram reveals that there is a tendency to grouping by region, by forming groups which are isolated from one state, composed of two states in the region, but also form groups with states in different regions. A general discrimination for VNTR's of 0.99 was obtained. Diversity results for each of the loci ranged from 0.239-0.857. The loci that presented the highest discriminatory power was 2461 (D = 0.857) followed by 0577 (D = 0.804), while the 2686 (0.239) had the lowest discriminatory power.
URI: http://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/852
Other Identifiers: Genotipificación
Genotyping
Mycobacterium bovis
Mycobacterium bovis
Tuberculosis
Tuberculosis
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