Methodology to perform demographic inferences using ancient and modern samples

Liliana Chavaje Avila

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dc.rights.license	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0	es_ES
dc.contributor	Vicente Diego Ortega Del Vecchyo	es_ES
dc.contributor	Roberto Augusto Gómez Loenzo	es_ES
dc.contributor	Luisa Ramírez Granados	es_ES
dc.contributor	Angélica Rosario Jiménez Sánchez	es_ES
dc.creator	Liliana Chavaje Avila	es_ES
dc.date	2023-01-31
dc.date.accessioned	2024-02-02T21:22:55Z
dc.date.available	2024-02-02T21:22:55Z
dc.date.issued	2023-01-31
dc.identifier.uri	https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/9907
dc.description	La secuenciación de genomas antiguos nos permite trazar mejor nuestra historia mediante el estudio conjunto de genomas de individuos del presente y del pasado. El análisis de estos genomas requiere de la aplicación y desarrollo de métodos estadísticos y computacionales que nos permitan inferir la historia que mejor explica los patrones de diversidad genética observada en los genomas estudiados. Un estadístico de diversidad genética muy utilizado para la inferencia de la historia es el espectro de frecuencias por sitio. Este estadístico ha sido ampliamente utilizado para inferir el pasado empleando genomas modernos. Sin embargo, todavía no se ha analizado a profundidad la posibilidad de utilizar este estadístico para inferir la historia demográfica en el pasado mediante el análisis conjunto de genomas modernos y antiguos. En esta tesis realizo un análisis computacional para evaluar si el espectro de frecuencias por sitio es informativo para inferir un parámetro demográfico muy informativo sobre la historia en el pasado, el tiempo de divergencia entre poblaciones. Para llevar esto a cabo, se desarrolló una metodología que permite calcular el espectro de frecuencias por sitio a través de un conjunto de genomas simulados. Las simulaciones que se llevan a cabo muestran que el espectro de frecuencias por sitio es sensible a cambios del tiempo de divergencia entre poblaciones y del tamaño de muestra en una población antigua. Los análisis muestran que el tiempo de divergencia es ligeramente subestimado bajo simulaciones con tiempos de divergencia que son cercanos al tiempo de divergencia entre distintas poblaciones en América. Se encuentra que un aumento en el tamaño de muestra mejora los estimados del tiempo de divergencia. Los resultados muestran que es conveniente realizar simulaciones para validar si, dado un cierto diseño de estudio con tamaños específicos de muestra en una población antigua, es posible realizar estimaciones certeras de parámetros demográficos de interés como el tiempo de divergencia.	es_ES
dc.format	Adobe PDF	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Autónoma de Querétaro	es_ES
dc.relation.requires	Si	es_ES
dc.rights	Acceso Abierto	es_ES
dc.subject	Ciencias Físico Matemáticas y Ciencias de la Tierra	es_ES
dc.subject	Matemáticas	es_ES
dc.subject	Estadística	es_ES
dc.title	Methodology to perform demographic inferences using ancient and modern samples	es_ES
dc.type	Tesis de maestría	es_ES
dc.creator.tid	CVU	es_ES
dc.contributor.tid	CVU	es_ES
dc.creator.identificador	958062	es_ES
dc.contributor.identificador	358780	es_ES
dc.contributor.role	Director	es_ES
dc.contributor.role	Secretario	es_ES
dc.contributor.role	Vocal	es_ES
dc.contributor.role	Suplente	es_ES
dc.degree.name	Maestría en Ciencias línea terminal en Ingeniería Matemática	es_ES
dc.degree.department	Facultad de Ingeniería	es_ES
dc.degree.level	Maestría	es_ES