Para realizar experimentos de manipulación genética en los organismos, es necesario contar con marcadores de selección que permitan identificar dentro de una población al organismo que porta la modificación genética realizada. El cambio generado puede ser interrumpir un gen o sobreexpresarlo. Generalmente existen dos tipos de marcadores, los que confieren resistencia a antibióticos y los auxotróficos. En el caso de U. maydis, actualmente se utilizan cuatro marcadores que confieren resistencia a antibióticos como son: la Higromicina B, Carboxina, Fleomicina y Nourseotricina. Sin embargo, en este hongo no se ha implementado el uso de marcadores de selección auxotróficos. U. maydis tiene gran importancia tanto en la investigación básica como en la biotecnología. Por lo que en este trabajo analizamos la factibilidad del uso del gen PYR4 para ser empleado como marcador de selección en este basidiomicete. De tal manera que, si la intención es utilizar a U. maydis en algún proceso biotecnológico por ejemplo aplicado al sector agrícola, será importante y deseable modificar cepas que no porten resistencia a antibióticos, facilitando así su aceptación por cuestiones de regulación. La auxotrofía es la pérdida de la capacidad del organismo para sintetizar cierto compuesto, por lo tanto, es necesario que éste se suplemente de manera exógena al medio de cultivo. Usualmente estos marcadores de selección auxotróficos corresponden a genes involucrados en la síntesis de aminoácidos o bases nitrogenadas. El gen PYR4 codifica la enzima Dihidroorotato deshidrogenasa, encargada de catalizar la conversión de dihidrorotato (DHO) a orotato, se localiza en la membrana mitocondrial y es una de las enzimas involucradas en la síntesis de pirimidinas. La deleción de este gen causa auxotrofía a uracilo en las cepas de U. maydis, sensibilidad a estrés osmótico y oxidativo, y la incapacidad para producir enfermedad en maíz. La complementación de las mutantes Δpyr4 con dos versiones de gen silvestre PYR4 que difieren en el tamaño de sus regiones 5’ y 3’ regulatorias, permite la recuperación del fenotipo silvestre. Por lo tanto, se propone al gen PYR4 como marcador de selección auxotrófico en este hongo, además, con la relación filogenética y evolutiva puede emplearse con otros hongos fitopatógenos de importancia agrícola, como Ustilago hordei, Sporisorium reilianum, entre otros.