La sociología en particular, y las ciencias sociales en general, se encuentra en una situación donde en un mismo momento subsisten varios paradigmas y una multitud de teorías; la distinción de la naturaleza y la identificación de las diferencias entre las teorías y sus respectivos paradigmas no son claros. En la primera parte de este trabajo se presenta una descripción de la situación, así como de diferentes acercamientos que se le han dado; para posteriormente presentar una alternativa en la identificación y caracterización de estas diferencias, utilizando una propuesta de la filosofía de la ciencia: La Visión Estructuralista de las Teorías Científicas. Esta propuesta hecha mano de herramientas como la teoría de conjuntos y la lógica simbólica, pero principalmente de la noción de modelos como base para la reconstrucción de teorías. Para demostrar la factibilidad esta propuesta en las ciencias sociales se reconstruyen y comparan dos teorías de la sociología de las organizaciones, la teoría de los Sistemas Organizacionales Autopoiéticos de Niklas Luhmann y lo que aquí se denominó la Teoría del Análisis Organizacional, cercano a la fenomenología pero sobre todo producto contemporáneo de distintos acercamientos al estudio de las organizaciones.