La instrumentación mecánica no proporciona suficiente desinfección de los conductos radiculares, por lo que es indispensable el uso de irrigantes para eliminar los microorganismos. Estos desempeñan un papel esencial en la etiología y desarrollo de los procesos infecciosos e inflamatorios en el tejido pulpar; el Streptococcus mutans metaboliza una amplia variedad de hidratos de carbono, con los cuales da lugar a la producción de ácido láctico desmineralizando la porción inorgánica, destruyendo la porción orgánica y causando agresión al sistema de conductos. Objetivo: Determinar la efectividad antimicrobiana de tres irrigantes endodónticos contra Streptococcus mutans. Metodología: Se realizó un estudio experimental, longitudinal prospectivo y de correlación, en el cual se inoculó Streptococcus mutans en 33 cajas Petri con agar sangre, para su crecimiento y reproducción. Se colocaron sensidiscos humedecidos con las soluciones irrigantes; se observaron y midieron los halos de acción bactericida resultantes a las 24 y 48 horas de incubación. Resultados: A las 24 y 48 horas de haber colocado los sensidiscos, se observó diversidad en la amplitud de los halos de acción bactericida; la clorhexidina mostró el mayor porcentaje con un 39.4% contra el Streptococcus mutans. Al realizar ANOVA de una vía, se encuentra una diferencia estadística entre todas las muestras de p =0.0001. Conclusión: En este estudio se presenta una correlación positiva para el uso de clorhexidina al 2% contra el Streptococcus mutans.