La obesidad y sobrepeso son un grave problema de salud pública que afecta por igual a niños y adultos. Son considerados factores de riesgo para la aparición de complicaciones secundarias como enfermedades crónico-degenerativas (diabetes mellitus tipo 2) y enfermedades cardiovasculares entre otras. La prevalencia de obesidad y sobrepeso (ObySp) se incrementa con la edad, siendo en escolares del 34.4 %, aumentando a más del doble en la edad adulta. El componente genético (genotipo) se considera un factor predisponente para el desarrollo de obesidad infantil bajo la presencia de un ambiente obesogénico. Con el objetivo de estimar la relación entre el componente genético y un perfil clínico y bioquímico característico de obesidad y sobrepeso en escolares, se midieron variables antropométricas, bioquímicas, fisiológicas y genéticas en escolares de 8-13 años de edad. La prevalencia encontrada de obesidad y sobrepeso fue de 19.83% y 19.2%, respectivamente; dichas prevalencias fueron mayores que lo reportado por ENSANUT 2012 (14.46% y 19.8% para obesidad y sobrepeso). Asimismo, se encontró una asociación significativa entre la presencia del SNP rs9939609 (FTO) con la presencia de obesidad (OR: 3.87, 95% IC: 1.46-10.22). De igual forma en el caso del rs17782313 (MC4R) se encontró una asociación significativa con la obesidad (OR: 2.13, 95% IC: 1.22-3.71). Esta observación no pudo ser replicada para el caso del rs6548238 (TMEM18).