El cáncer cérvicouterino (CaCu) es el segundo cáncer en frecuencia en mujeres en todo el mundo. La infección por Virus de Papiloma Humano (VPH) ha sido reconocida como factor etiológico para el desarrollo de CaCu. Debido a la magnitud en México, se considera un problema de Salud Pública, por lo que se hace necesario contar con un tamizaje efectivo para la detección oportuna de CaCu. El objetivo del estudio fué establecer una asociación a partir de los resultados de PCR para VPH y citología líquida de mujeres. Se realizó un estudio observacional, descriptivo y transversal en Querétaro durante 2015 con un programa piloto de tamizaje para CaCu. Se realizaron 13,000 muestras en mujeres de entre 35 a 64 años de edad que acudían a su unidad médica. El universo de estudio fueron los casos positivos de PCR para VPH, a las cuales se les realizó citología líquida. Se utilizó el cuestionario de solicitud y reporte de detección de VPH-AR de la Secretaría de Salud. Se obtuvo la autorización por el LESP para llevar a cabo el trabajo de campo bajo las normas éticas para la obtención de resultados. Se obtuvieron 1001 (7.7%) resultados positivos a VPH. De acurdo a la clasificación de prevalencia se observó que 864 (86.3%) fueron positivas a pool de 12 genotipos, 166 (16.6%) positivas al genotipo 16, 48 (4.8%) positivas al genotipo 18. De acuerdo al resultado citológico se observó que 650 (65%) presentaron resultados normales, 251 (25%) LEIBG/Displasia Leve/NIC 1/VPH, 72(7.2%) presentó LEIBG/VPH. Se estableció una asociación de pool de 12 genotipos con LEIBG/VPH con una O.R. =2.840; la asociación de pool de 12 genotipos con LEIBG/Displasia Grave/NIC 3 es de O.R. =0.52. La introducción del esquema PCR para VPH combinado de la prueba de citología líquida en aquellas mujeres con VPH positivo incrementa el valor predictivo positivo de una citología anormal. A partir de los resultados obtenidos se implantó una capacitación para el manejo del cuestionario de solicitud y reporte de detección de VPH-AR de la Secretaría de Salud que unificó criterios de llenado, para la correcta realización de este.