La fragmentación del hábitat ocasionada por la construcción de presas puede tener efectos directos e indirectos sobre la biota acuática, que algunas veces se acentúan por la introducción de especies exóticas. La hidroeléctrica ¿lng. Femando Hiriart Balderrama", también conocida como embalse Zimapán, se ubica en la cuenca del río Pánuco y fue construida en 1995. El presente trabajo incluye el análisis histórico desde 1992 de los cambios generados en la composición y estructura de las comunidades biológicas y de tos procesos involucrados en la sustitución o reemplazo de las especies nativas por la construcción de la presa. El estudio se enfocó en tres ejes principales: 1) la evolución del ecosistema, 2) el entendimiento de los cambios en el fitoplancton y 3) el cálculo del índice de crecimiento alométrico y del factor de condición en los peces. Se seleccionaron cinco sitios de muestreo en el embalse, relacionados con la profundidad, flujo de agua e influencia del viento. Los valores de calidad de agua formaron un gradiente desde el sitio 1 (Taxhidó), donde la calidad es mejor, al sitio 5 (Tasquillo) de calidad pobre. El embalse se comporta como un sistema subtropical monomíctico, con estratificación en primavera-verano. La calidad de agua está principalmente determinada por las concentraciones altas de nutrimentos, de sólidos suspendidos y disueltos, además de la temperatura y el oxígeno disuelto. La composición del fitoplancton es indicativa de un ecosistema de alta productividad, donde predominaron las diatomeas, cianofíceas y clorofíceas, y la comunidad mostró una clara secuencia temporal en su composición y abundancia, así como florecimientos de algunos taxa, tales como Microcystls aeruginosa. Entre los peces, sólo se encontró una especie nativa (Poedlla mexlcana). La ictiofauna estuvo dominada por las especies exóticas (principalmente Oreochromis mossambícus) que son objeto de pesquería. También, se detectaron cambios en el índice alométrico del crecimiento (de 3.2 a 2.7) y en la salud de las poblaciones (K de 5.6 a 2.97). Los resultados conjuntos del agotamiento de oxígeno a 15m de profundidad, la presencia de algunas cianofíceas y los florecimientos repentinos, sugieren que el embalse se encuentra en estado eutrófico. Se concluye que la pérdida de la fauna nativa de peces es el producto del efecto sinérgico de las nuevas condiciones ambientales producto del embalsamiento y de interacciones con las especies exóticas. Estos resultados indican que se requiere de nuevas estrategias, que incluyan el concepto de manejo integral de cuenca, así como una administración adecuada de las compuertas, lo que conducirá a mejorar las condiciones ambientales generales del embalse Zimapán y la salud de sus comunidades biológicas