Redes multicapa como herramienta de análisis de la microbiota

Víctor Lázaro Vidal

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dc.rights.license	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0	es_ES
dc.contributor	Roberto Carlos Alvarez Martinez	es_ES
dc.creator	Víctor Lázaro Vidal	es_ES
dc.date	2022-05-12
dc.date.accessioned	2022-05-19T19:13:16Z
dc.date.available	2022-05-19T19:13:16Z
dc.date.issued	2022-05-12
dc.identifier.uri	http://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/3620
dc.description	En biología existen múltiples ejemplos de sistemas complejos, es decir, sistemas conformados por una gran cantidad de componentes que interactúan entre sí, y cuyo comportamiento sólo puede entenderse como el producto de las interacciones de tales componentes. Un ejemplo de este tipo de sistemas es la microbiota, donde distintos microorganismos interactúan entre sí, con los tejidos del hospedero y con su entorno. Las redes son una herramienta matemática sumamente útil en el análisis de sistemas complejos, sin embargo, el enfoque tradicional enfrenta ciertas limitaciones, pues los sistemas biológicos son sistemas dinámicos que cambian en el tiempo y en función de las condiciones. Ante tales retos, las redes multicapa se presentan como un nuevo paradigma en el análisis de sistemas complejos. Empleando redes multiplex, analizamos bases de datos obtenidas a partir de muestras de la microbiota de dos organismos estrechamente relacionados, la solanácea Datura inoxia y el escarabajo Lema daturaphila. Las redes de coabundancia fueron generadas mediante los algoritmos de inferencia SparCC y ARACNe. Se hallaron comunidades bacterianas involucradas en la fijación de nitrógeno en la capa de la solanácea, mismas que podrían tener una relación mutualista con los tejidos de la planta. Tanto en la solanácea como en el escarabajo se encontraron comunidades bacterianas asociadas al tejido intestinal del insecto, lo que en la solanácea podría derivarse de la materia fecal depositada por las larvas mientras se alimentan de la planta. Bajo el enfoque de las redes temporales, se analizaron datos de dos sujetos que experimentaron cambios en su microbiota derivados de procesos infecciosos. Las redes ARACNe de ambos sujetos mostraron alteraciones en la arquitectura de las redes durante los periodos de disbiosis asociados a procesos infecciosos, lo que podría indicar alteraciones en la dinámica de la microbiota. También se identificaron proporciones alteradas de los phyla durante los estadios de disbiosis. Además, gran parte de los nodos encontrados en una misma comunidad eran filogenéticamente cercanos. El uso de redes multicapa nos permitió encontrar patrones en las comunidades bacterianas que podrían estar asociados a procesos puntuales, como la liberación de AGCCs y el metabolismo de determinados nutrientes.	es_ES
dc.format	Adobe PDF	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.relation.requires	No	es_ES
dc.rights	Acceso Abierto	es_ES
dc.subject	Microbiota	es_ES
dc.subject	Redes multicapa	es_ES
dc.subject	Redes temporales	es_ES
dc.subject	Disbiosis	es_ES
dc.subject	Redes de coabundancia	es_ES
dc.subject.classification	BIOLOGÍA Y QUÍMICA	es_ES
dc.title	Redes multicapa como herramienta de análisis de la microbiota	es_ES
dc.type	Tesis de licenciatura	es_ES
dc.creator.tid	curp	es_ES
dc.contributor.tid	curp	es_ES
dc.creator.identificador	LAVV970710HVZZDC02	es_ES
dc.contributor.identificador	AAMR760903HDFLRB09	es_ES
dc.contributor.role	Director	es_ES
dc.degree.name	Licenciatura en Microbiología	es_ES
dc.degree.department	Facultad de Ciencias Naturales	es_ES
dc.degree.level	Licenciatura	es_ES