Introducción. El virus del papiloma humano es considerado como el principal factor de riesgo para cáncer cervicouterino aunado a otros factores de riesgo. En el 2012, se universalizó la vacuna contra el VPH con fin de proteger a las mujeres antes de la exposición a este virus y así disminuir la incidencia de esta neoplasia. Actualmente se desconoce si existe diferencia en las mujeres vacunadas mexicanas en relación con la conducta sexual y/o la exposición a factores de riesgo. Objetivo general. Comparar los factores de riesgo para cáncer cervicouterino en estudiantes con y sin vacunación contra el virus del papiloma humano. Metodología. Estudio transversal analítico, en estudiantes pertenecientes a la Unidad de Medicina Familiar No. 9. Se incluyeron aquellas con vida sexual activa, que aceptaron participar y presentaron consentimiento informados por ellas y por su tutor, se excluyeron aquellas con antecedente de sexo servicio y abuso sexual y se eliminaron las encuestas incompletas. El tamaño de muestra se calculó con la fórmula de comparación de 2 proporciones, n=209 por grupo. Se estudiaron las características de la población, factores de riesgo modificables y no modificables. El plan de análisis estadístico incluyó promedios, desviación estándar, porcentajes, prueba de t para poblaciones independientes, prueba de Mann Whitney, intervalos de confianza para porcentajes y prueba de chi cuadrada. Resultados. La edad promedio del grupo con vacuna fue 16.35±0.85 y sin vacuna 16.33±0.99 (p=0.84). En el primer grupo el antecedente de tabaquismo fue del 28.4% y en el segundo 26.9% (p=0.75); 22.5% y 32.4% respectivamente no utilizan preservativo durante la relación sexual (p=0.42). Ninguno de los grupos utilizó por más de 5 años hormonales orales. La edad promedio de la primera relación sexual en el grupo vacunado fue a los 15.06±1.20 y en el grupo sin vacuna 14.81±1.36 (p=0.08), el promedio de parejas sexuales fue 1.82±1.46 y 1.90±1.38 respectivamente (p=0.53). En cuanto al número de embarazos promedio, vacunadas 7% y no vacunadas 8% (p=0.78), la prevalencia de partos fue de 1% para las primeras y 0% en las segundas. En adolescentes que cursaron con embarazo la prevalencia de legrado fue 21.7% y 22.2% respectivamente (p=0.97), el antecedente de enfermedad de trasmisión sexual en el grupo con vacuna fue 27.1% y en el grupo sin vacuna 20.4% (p=0.16). Conclusión. No existe diferencia de la prevalencia de factores de riesgo en adolescentes con vacuna y sin vacuna, la excepción se identifica en el uso de preservativo (factor modificable).