La babesiosis bovina es la enfermedad transmitida por garrapatas más importante del ganado bovino a nivel mundial, siendo Babesia bovis la especie que causa el cuadro clínico más grave. Actualmente existen vacunas vivas contra esta enfermedad, sin embargo, aunque efectivas, representan un gran número de inconvenientes por ser elaboradas a partir de sangre infectada de bovino. El desarrollo de vacunas que involucren ingeniería genética representa una alternativa más viable, segura y sustentable para combatir esta enfermedad que genera grandes pérdidas económicas. La proteína Enolasa, una enzima del metabolismo intracelular de la glucosa que presenta funciones “Moonlight”, ha demostrado tener potencial como candidato vacunal en diversos patógenos, entre ellos, organismos del género Babesia, sin embargo, no ha sido caracterizada en B. bovis. En este estudio se demostró la presencia y funcionalidad del gen enolasa en Babesia bovis mediante técnicas de biología molecular; se obtuvo la secuencia del gen enolasa de dos aislados de B. bovis de diferentes estados de la república y mediante técnicas bioinformáticas se identificaron dos péptidos con epítopos B en la proteína Enolasa de este organismo (ENOL-1 y ENOL-2). Los péptidos se obtuvieron sintetizados en un sistema multi-antigénico de 8 brazos (MAPS-8) con los cuales se inmunizaron conejos, demostrando generar títulos de anticuerpos de hasta 1:256,000 en conejos inmunizados con el péptido ENOL-1 y de 1:512,000 en conejos inmunizados con el péptido ENOL-2. Los anticuerpos obtenidos fueron capaces de reconocer al parásito mediante inmunofluorescencia indirecta en eritrocitos bovinos infectados. Estos análisis representan el inicio de la caracterización de dos posibles candidatos vacunales.