El trastorno límite de personalidad (TLP) es un trastorno mental caracterizado por impulsividad, alteración en la regulación emocional, así como de relaciones interpersonales. Los síntomas están relacionados con hipofuncionalidad de zonas frontales como la Corteza Prefrontal Dorsomedial (CPFDM). La psicoterapia es el tratamiento base de esta enfermedad, sin embargo, los costos económicos y la terapia a largo plazo han dificultado el apego al mismo. La Estimulación Magnética Transcraneal repetitiva (EMTr), autorizada por la FDA (Food and Drug Administration) como tratamiento para el Trastorno Depresivo Mayor (TDM) ha mostrado buenos resultados en trabajos previos con TLP, mejorando las características clínicas sobre Cortezas Prefrontales Dorsolaterales, y mejoría de la sintomatología depresiva sobre la CPFDM. Metodología. Se evaluaron un total de 67 sujetos, ingresando 27 (19 mujeres y 8 hombres). Los sujetos fueron evaluados clínicamente con escalas de síntomas para TLP, Depresión, Ansiedad e Impulsividad, así como pruebas neuropsicológicas para dominios como Control Inhibitorio, Toma de Decisiones y Flexibilidad Cognitiva. Los pacientes fueron aleatorizados en dos grupos (Activo y Placebo) recibiendo EMTr por tres semanas en cada modalidad y posteriormente se realizó un “crossover”, recibiendo la modalidad contraria por tres semanas. Resultados. Se observó mejoría significativa en los puntajes para el grupo de estimulación activa en las escalas clinimétricas Activa BSL: 56±26.13 vs 23.62±23.16 (p=0.0036), GCI-BPD:41.15±9.35 vs 20.31±9.53 (p=0.0004), BEST: 45±11.88 vs 27.46±9.56 (p=0.018), HDRS: 28.15±9.93 vs 14.85±7.42 (p=0.005), HARS: 27.38±9.5 vs 11.54±6.75 (p=0.0026), BIS: 63.31±14.6 vs 50.69±19.86 (p=0.187), Placebo: BSL: 39.25±19.29 vs 35±27.7, GCI-BPD: 36.5±11.72 vs 31.83±11.65, HDRS: 26.42±7.57 vs 24±10.57, HARS: 23.42±5.77 vs 21.58±10.01, BIS: 66.58±11.52 vs 58.58±18.07, BEST: 40±10 vs 36.92±13.34 (placebo, p=ns). Conclusiones. Estadísticamente se observa mejoría en la sintomatología para síntomas relacionados con ansiedad, depresión y propios del TLP en el grupo activo.