El zapoteco del istmo es la lengua zapoteca con el mayor número de hablantes en la actualidad. La presente investigación tuvo como objetivo la definición de sus zonas dialectales. La metodología contempló el levantamiento de datos en los nueve municipios con mayor numero de hablantes de zapoteco en la región del Istmo de Tehuantepec. Se ejecutó un modelo de análisis dialectológico basado en isoglosas en torno a fenómenos de variación fonológica y léxica. Además se realizaron análisis dialectométricos basados en modelos de agrupamiento jerárquico y sistemas de nodos de similitud. Los resultados mostraron la detección de tres dialectos basados en las relaciones de alta similitud entre los municipios de San Blas Atempa-Tehuantepec, Ixtaltepec-Ixtepec, y Juchitán-Xadani, además de la detección de zonas de transición en los municipios de El Espinal, Unión Hidalgo y Comitancillo.