En el contexto del cambio climático y de los compromisos nacionales e internacionales de mitigación, resulta indispensable contar con inventarios actualizados de emisiones de gases de efecto invernadero a escala estatal. El presente trabajo tiene como objetivo elaborar y comparar el inventario de emisiones del sector agrícola del estado de Querétaro para los años 2006 y 2023, siguiendo las Directrices del Panel Intergubernamental de Expertos sobre Cambio Climático (IPCC, 1996), con el fin de analizar la evolución de las principales fuentes emisoras y generar información base para la toma de decisiones. El inventario considera las emisiones provenientes de los suelos agrícolas y de la quema de residuos agrícolas en campo. Para ello, se utilizaron datos oficiales de producción agrícola y pecuaria, así como factores de emisión por defecto, aplicando una metodología de nivel 1. Los resultados indican que las emisiones totales del sector agrícola aumentaron de 2,273.21 Gg de CO₂ equivalente en 2006 a 2,407.01 Gg de CO₂ equivalente en 2023, lo que representa un incremento del 5.9 % en el periodo analizado. Los suelos agrícolas constituyen la principal fuente de emisiones en ambos años, debido principalmente a las emisiones directas e indirectas de óxido nitroso (N₂O) asociadas al pastoreo de animales, manejo del estiércol, aplicación de fertilizantes nitrogenados y lixiviación del nitrógeno. Asimismo, aunque la quema de residuos agrícolas representa una fracción menor del total, sus emisiones prácticamente se duplicaron entre 2006 y 2023. El inventario elaborado permite identificar tendencias, fuentes prioritarias de mitigación y áreas de mejora en el manejo del nitrógeno, constituyéndose como una herramienta fundamental para el diseño de estrategias estatales de mitigación del cambio climático en el sector agrícola.