Descripción:
La enzima SMUG1 forma parte del mecanismo de Reparación por Escisión de Bases
(BER) y escinde uracilo, derivado de la oxidación de timina o de la desaminación de
citosina metilada, en el ADN. Diversos estudios sugieren que cambios en el promotor
de genes asociados a este mecanismo pueden influir en el riesgo de desarrollar
cáncer. Este estudio incluyó a pacientes diagnosticados con cáncer de pulmón de
células no pequeñas, específicamente adenocarcinoma en etapa IV, con una edad
promedio de 76 años. A partir de muestras de sangre periférica, se llevó a cabo la
secuenciación de un fragmento del promotor del gen SMUG1. Posteriormente, se
realizó un estudio de docking molecular entre el factor de transcripción YY1 y la
secuencia analizada. En un paciente, se identificaron las variantes Chr12:54190744
G/A y Chr12:54190674 G/A, ubicadas en una región reguladora de cromatina abierta,
la cual esta silenciada por mecanismos epigenéticos en tejido pulmonar. Aunque no
se observaron cambios en la secuencia de unión entre los grupos, el análisis de
docking molecular reveló una interacción más fuerte y una mayor energía
electrostática entre YY1 y esta región, en comparación con la secuencia cocristalizada
previamente
reportada
para
este
factor.
Dado
que
no
se
ha
reportado
previamente
una
relación
entre
YY1
y
SMUG1,
este
hallazgo
sugiere
que
esta
región
podría
funcionar
como
una
zona
de
unión,
y
estudios
experimentales
reportan
que
esta
región
regula
negativamente
la
expresión
de
SMUG1.
Se
cree
que
las
variantes
encontradas
podrían
ser
relevantes
debido
a
su
baja
frecuencia
en
la
población y
su
ubicación
en el genoma. Además, este proyecto sugiere, por primera vez, la
interacción in silico entre el factor YY1 y el promotor de SMUG1 en una región de
cromatina abierta. Como perspectiva, se propone recopilar datos sobre la frecuencia
del alelo alternativo en la población mexicana, y realizar estudios adicionales que
ayuden a comprender el papel de YY1 en la regulación del gen SMUG1.