La perspectiva de la complejidad es un territorio en disputa, diversas tradiciones la alimentan y científicos de múltiples disciplinas la configuran. Sin embargo, hay un pensamiento común: hay problemas que no pueden ser abordados en solitario por las disciplinas científicas heredadas del siglo XIX. Este artículo retomó las visiones de Edgar Morín y Nikklas Luhmann. A partir de ellas y las reflexiones de autores vinculados a ellos, se exponen las razones por las cuales el desarrollo de un territorio sub-nacional es un problema complejo. Para fortalecer este argumento se realiza un ejercicio teórico sobre cómo explorar el desarrollo subnacional desde esta perspectiva.