La proteína de resistencia a múltiples fármacos (MRP4) es un transportador de membrana clave en la expulsión de una amplia gama de sustratos, incluyendo varios agentes quimioterapéuticos. Alteraciones en MRP4 están asociadas con diversas patologías, particularmente en el cáncer, y su sobreexpresión se vincula con un pronóstico desfavorable. Mutaciones no sinónimas en MRP4 producen patrones de transporte alterado, contribuyendo a la resistencia a fármacos como el metotrexato. Esto resalta la importancia de investigar los mecanismos de reconocimiento de sustratos y los efectos de las modificaciones estructurales de MRP4 sobre su capacidad de transporte. El objetivo de este proyecto fue comparar los efectos de dos variantes mutantes de MRP4 (F368W y R375S) con el modelo de tipo salvaje (WT) para evaluar los efectos de las mutaciones en la estructura de la proteína y su afinidad por ligandos, tanto endógenos como farmacológicos. Se utilizaron herramientas de química computacional, incluyendo modelado por homología, simulaciones de dinámica molecular y acoplamiento molecular. Los resultados in silico revelaron diferencias conformacionales significativas entre las variantes F368W y R375S en comparación con el modelo WT. El modelo F368W mostró una estructura similar a WT, pero con movimientos reducidos en los dominios transmembranales 6 y 12. En cambio, R375S adoptó una conformación más comprimida con pasos transmembranales 6 y 12 estáticos. A pesar de las diferencias estructurales, los puntajes de acoplamiento molecular para los sustratos endógenos no mostraron cambios significativos, excepto para los sustratos PEG2 y LTB4, este último solo en F368W. Sin embargo, F368W si mostró diferencias significativas en más de la mitad de los sustratos fármacos, mientras que R375S solo presentó cambios en la leucovorina, hidroclorotiazida y furosemida. Estos resultados indican que la mutante F368W altera el transporte de sustratos farmacológicos, subrayando la relevancia mecanística de este aminoácido en el transporte diferencial de fármacos. Este hallazgo destaca el potencial de la fenilalanina 368 en el desarrollo de inhibidores específicos para MRP4 con aplicaciones terapéuticas, especialmente en el contexto de la leucemia.