El comportamiento de las comunidades microbianas es el resultado de las interacciones entre las diversas poblaciones que las constituyen y su entorno. Estas comunidades son capaces de absorber perturbaciones ambientales y mantener su estructura. Sin embargo, alteraciones suficientemente grandes en las condiciones ambientales pueden interrumpir la composición y dinámica de las comunidades microbianas, un fenómeno que aún no se comprende completamente. En este estudio, se emplearon modelos matemáticos basados en interacciones y consumo de recursos para simular el comportamiento de las comunidades bacterianas y su respuesta a las perturbaciones. Además, se utilizaron datos publicados para analizar cómo responden estas comunidades a las perturbaciones bajo diferentes condiciones. Los análisis revelaron que la resiliencia y la capacidad de recuperación de las comunidades están condicionadas por el tipo de interacciones. Además, las perturbaciones conducen a cambios en la composición de la comunidad, un aumento en la dominancia de ciertas poblaciones, una reducción en la diversidad y alteraciones en términos de co-abundancias entre estados.