https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/4221 Mon, 24 Aug 2026 11:52:59 GMT 2026-08-24T11:52:59Z https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13192 Efecto de la Selección Dependiente de la Frecuencia en una comunidad bacteriana sintética multiespecie Valeria Hernández Zendejas Comprender los mecanismos que regulan el ensamblaje de las comunidades es clave para predecir su respuesta a cambios ambientales. En particular, explicar cómo se mantiene la diversidad microbiana ante variaciones en la composición y disponibilidad de recursos sigue siendo un desafío en ecología evolutiva. La selección dependiente de la frecuencia negativa, donde las especies raras son favorecidas, se ha propuesto como un mecanismo que promueve la coexistencia. En esta tesis se evaluó si la coexistencia en comunidades bacterianas está mediada por este tipo de selección y cómo varía según la identidad de las especies y el ambiente. Para ello, se utilizaron comunidades sintéticas intra- e inter-género, manipulando la frecuencia inicial de las especies y el tipo de medio. Además, se emplearon simulaciones con un modelo de Lotka-Volterra generalizado para explorar la estabilidad de las comunidades. Los resultados muestran que, en la comunidad intra-género, los efectos de la frecuencia y la identidad de especie dependen de su interacción a tiempos tempranos, pero se debilitan con el tiempo, sin influencia del medio. En la comunidad inter-género, la dinámica depende fuertemente de la frecuencia, el ambiente y la identidad, con dominancia en medio rico y colapso en medio mínimo. Las simulaciones reproducen estas tendencias generales, aunque predicen principalmente escenarios de exclusión con pocos casos de coexistencia. En conjunto, estos resultados sugieren que la selección dependiente de la frecuencia no actúa de manera consistente en el tiempo ni entre contextos, y que su papel en el mantenimiento de la diversidad está fuertemente condicionado por la identidad de las especies y la disponibilidad de recursos. Wed, 31 Dec 2036 00:00:00 GMT https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13192 2036-12-31T00:00:00Z https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13188 Análisis metagenómico de la microbiota en la pared corporal del gasterópodo Deroceras laeve Mayela Guadalupe Fosado Mendoza La microbiota de los gasterópodos terrestres ha sido poco estudiada en comparación con la de moluscos marinos y dulceacuícolas, a pesar de que estas especies mantienen un contacto constante con el suelo y la materia orgánica que favorece interacciones frecuentes con comunidades microbianas del entorno. En este trabajo se caracterizó la microbiota asociada a la pared corporal de Deroceras laeve mediante metagenómica tipo shotgun, con el objetivo de describir su composición taxonómica, su diversidad y su potencial funcional. Se identificaron organismos pertenecientes a cuatro dominios: Bacteria, Eukaryota (hongos), Virus y Archaea. A nivel de filo, la composición fue comparable a la de otros moluscos, con Pseudomonadota, Bacillota, Ascomycota y Euryarchaeota como grupos dominantes en sus respectivos dominios. La diferenciación de D. laeve fue más evidente a nivel de género, donde se detectaron taxones como Streptomyces, Acinetobacter y Paenibacillus en bacterias; Thermococcus, Acidianus y Halomicrobium en arqueas; y Tequatrovirus en virus, los cuales no figuraron entre los más abundantes en los otros moluscos analizados. El análisis funcional basado en KEGG mostró que el metabolismo de carbohidratos y aminoácidos fue el núcleo funcional compartido entre los cuatro dominios, mientras que cada uno presentó particularidades propias: biosíntesis de metabolitos secundarios en bacterias, metabolismo energético en arqueas, procesamiento de información genética en hongos, y una amplia representación funcional vinculada a Mimivirus en virus. Los análisis de diversidad alfa y beta mostraron comunidades diversas y equitativas, con una composición diferenciada respecto a los moluscos acuáticos y un agrupamiento consistente con moluscos terrestres. Este estudio representa una de las primeras caracterizaciones metagenómicas de la microbiota de la pared corporal de D. laeve y ofrece una base de referencia para futuros estudios sobre las interacciones hospedero–microbiota en gasterópodos terrestres. Sat, 10 Jul 2027 00:00:00 GMT https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13188 2027-07-10T00:00:00Z https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13187 Ensamblaje transcriptómico de novo y análisis de expresión diferencial durante la regeneración en Deroceras laeve Emilio Ortiz Avila La regeneración permite restaurar estructuras dañadas o perdidas, aunque los mecanismos moleculares que la regulan permanecen poco caracterizados en moluscos, particularmente en gasterópodos terrestres. Deroceras laeve es capaz de regenerar la región caudal tras amputación, por lo que representa un sistema útil para explorar la respuesta molecular temprana al daño en gasterópodos no modelo. En este trabajo se analizaron datos de Bulk RNA-seq para identificar cambios de expresión génica posteriores a la amputación de la cola en D. laeve. Para ello, se generó un ensamblaje de novo del transcriptoma, se estimaron abundancias transcriptómicas y se compararon muestras control y muestras obtenidas 48 horas después de la amputación mediante un análisis de expresión diferencial. También se anotaron funcionalmente los transcritos ensamblados y diferencialmente expresados. El ensamblaje final presentó métricas adecuadas de alineamiento y completitud, lo que respaldó su uso como referencia para la cuantificación y el análisis diferencial. En conjunto, los transcritos diferencialmente expresados con anotación funcional sugieren que la amputación caudal en D. laeve se asocia con una reorganización transcriptómica temprana relacionada con remodelación tisular, reorganización celular, plasticidad neural, ajuste metabólico y modulación de transcritos vinculados con proliferación, tráfico vesicular y sistema endolisosomal. Fri, 31 Dec 2027 00:00:00 GMT https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13187 2027-12-31T00:00:00Z https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/12860 Análisis del efecto de la hormona de crecimiento (GH) sobre la conectividad del nervio óptico con los colículos superiores y la corteza visual primaria en un modelo de glaucoma Karla Lissette Rosales Rosas El glaucoma es una de las principales causas de discapacidad visual irreversible, caracterizada por la degeneración progresiva del nervio óptico. Para su estudio, se han empleado distintos modelos, como el de compresión de nervio óptico (ONC), en donde se ha demostrado que la hormona de crecimiento (GH) ejerce efectos neuroprotectores, regenerativos y antiinflamatorios sobre la retina. Sin embargo, su papel en otras estructuras visuales, como los colículos superiores (CS) y la corteza visual, sigue siendo poco comprendido. En este estudio se evaluaron los efectos de la GH en los CS siguiendo el modelo de ONC en ratas Wistar macho de seis semanas de edad. Se administró GH bovina (0.5 mg/kg/12h) de manera subcutánea durante 14 días, y se evaluaron los niveles de expresión de marcadores inflamatorios, neurotróficos y sinaptogénicos mediante qPCR e inmunofluorescencia de los CS contralaterales al daño. Los resultados mostraron que la GH no logra restablecer el transporte axonal anterógrado entre la retina y los CS, lo cual se evidenció por la ausencia de la señal de CTB en esta región. No obstante, el tratamiento modula principalmente la respuesta glial en los CS, incrementando la expresión de marcadores asociados con actividad microglial y astrocítica (Iba1, CD86, CD206 y GFAP). El análisis de inmunofluorescencia realizado corroboró esta actividad al mostrar una tendencia a incrementar la inmunorreactividad tanto de Iba1 como de GFAP. Por otra parte, la GH aumentó la expresión de BDNF y mostró una tendencia a restaurar los niveles de otros factores neurotróficos que disminuyeron tras la lesión (GDNF e IGF-1). Además, se planteó el posible papel de la GH para regular algunos mecanismos pre y postsinápticos a través de una tendencia a incrementar la expresión de marcadores sinápticos (NLGN1 y NRXN1) en fases tardías de la lesión. Estos hallazgos sugieren que la GH modula principalmente respuestas inflamatorias y gliales en los CS, promoviendo la expresión de factores neurotróficos y genes relacionados con la sinaptogénesis, lo que podría contribuir con la plasticidad neuronal en la vía visual después de la lesión. Sun, 10 Dec 2028 00:00:00 GMT https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/12860 2028-12-10T00:00:00Z