https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/8549 2026-08-12T03:21:05Z 2026-08-12T03:21:05Z Iñaki Estrada Serrano https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13170 2026-08-11T06:09:37Z 2028-10-01T00:00:00Z

Modelado y evaluación topológica de librerías de α-PNAs y su interacción con ADN Iñaki Estrada Serrano En este trabajo se presenta la evaluación computacional de topologías exohelicoidales de librerías de α-PNAs con linkers del tipo éter y la modulación de su interacción con ácido desoxirribonucleico (ADN) complementario de sola cadena (ssADN, single-stranded DNA). Fue empleada la familia de aminoácidos artificiales (NCAA, Non-Canonical Amino Acids) que contienen las nucleobases canónicas (A, T, G, C) parametrizadas utilizando cálculos cuánticos (HF/6-31G*) y el campo de fuerzas AMBER03. Las librerías de α-PNAs fueron construidas con patrones de repetición naturales y artificiales [(i, i+7); (i, i+4); (i, i+(3+4))], y estudiadas a través de simulaciones de dinámica molecular utilizando el software de GROMACS. El análisis de las trayectorias de estas simulaciones permitió calcular parámetros de estabilidad estructural, como el porcentaje de helicidad (%α), los ángulos diedros (Φ, ψ), el ángulo azimutal (Ω) y el ángulo de rotación exo-helicoidal (χ). Cada estructura fue modelada interaccionando contra su hebra complementaria de ADN utilizando una geometría ideal capaz de generar híbridos α-PNA-ADN con parámetros representativos de la conformación B-ADN, principalmente. La capacidad de hibridación se caracterizó mediante el análisis de trayectorias procedente de simulaciones de dinámica molecular descendentes. Para ello, se analizó la distancia de puentes de hidrógeno, las interacciones de apilamiento π (π stacking) y la planaridad. Estos resultados proveen un espacio químico amplio para el diseño racional de α-PNAs con una selectividad optimizada hacia dianas genética.

2028-10-01T00:00:00Z Nadia Allina Lozano Segura https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13159 2026-08-06T16:15:07Z 2026-07-02T00:00:00Z

Efecto vasodilatador de una fracción de ácidos triterpénicos del extracto metanólico de hojas de Crataegus rosei e identificación de sus compuestos minoritarios Nadia Allina Lozano Segura Las enfermedades cardiovasculares (ECV), entre ellas la hipertensión arterial (HTA), son la principal causa de muerte en el mundo, incluido México. La HTA engendra todas las demás ECV. Los factores de riesgo para desarrollar las ECV incluyen los no modificables (edad, el sexo, antecedentes familiares) y los que sí lo son, como la mala alimentación, el sedentarismo, el consumo de alcohol y la obesidad. Existe una gran variedad de fármacos para tratar las ECV, pero todos tienen efectos secundarios importantes. Esto resalta la necesidad de encontrar nuevos candidatos a fármacos más seguros y efectivos, como los que pueden provenir de las plantas medicinales. Las plantas del género Crataegus se han utilizado de manera tradicional para tratar esas enfermedades. Entre los principios activos identificados en el género, se encuentran los ácidos triterpénicos (ÁT). El presente proyecto se enfocó en obtener, a partir del extracto metanólico (EMCr) de hojas de Crataegus rosei, una fracción enriquecida en AT (FÁT), evaluar su efecto vasodilatador y purificar sus constituyentes minoritarios, para explorar su potencial vasorrelajante. Para lograrlo, el EMCr se sometió a fraccionamiento en una columna cromatográfica para obtener la fracción de ÁT. Los efectos vasorrelajantes de ambos se determinaron utilizando aorta aislada de rata. El EMCr presentó un Emáx (efecto máximo) vasorrelajante de 77.17 ± 3.62 % y la FÁT un Emáx mayor (101 ± 5.87%). La purificación de los ÁT minoritarios se realizó mediante HPLC y su identificación, mediante RMN. Hasta el momento, solo se ha logrado obtener de manera pura al ácido pomólico (1.37 mg/g de hojas secas de Crataegus rosei). Los resultados obtenidos indican que es preferible utilizar la FÁT para obtener un mayor efecto vasorrelajante.

2026-07-02T00:00:00Z Beatriz Franco Chávez Luis Ángel Urdez Rojas https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13105 2026-07-04T06:09:56Z 2026-06-30T00:00:00Z

“IDENTIFICACIÓN in silico DE POTENCIALES INHIBIDORES DE MRP4/ABCC4 PARA EL TRATAMIENTO DE LA LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA Beatriz Franco Chávez; Luis Ángel Urdez Rojas La leucemia linfoblástica aguda (LLA) es la leucemia más frecuente en niños y adolescentes; aunque la supervivencia infantil supera el 90 %, en adultos es menor al 40 % debido principalmente a la quimiorresistencia. En este contexto, la sobreexpresión del transportador MRP4 representa un factor clave de resistencia a fármacos quimioterapéuticos, debido a su participación en la expulsión de fármacos citotóxicos, posicionándolo como una diana terapéutica prometedora. En este proyecto, se identificaron potenciales inhibidores de MRP4 mediante estrategias in silico basadas en acoplamiento molecular a gran escala, comparando un flujo de trabajo clásico con un protocolo que integró herramientas de quimioinformática. Se exploraron 36,454 compuestos naturales del Natural Products Atlas para la búsqueda de nuevos inhibidores, así como 9,125 fármacos de DrugBank bajo una estrategia de reposicionamiento. El enfoque alternativo implementó filtros de exclusión estructural y toxicológica (Brenk, NIH, PAINS), normalización de afinidad (SILE) y una Optimización Multiparamétrica (MPO) para priorizar a los mejores candidatos, además de la ejecución de Ensemble Docking, que permitió considerar la flexibilidad conformacional de MRP4. Los mejores candidatos se evaluaron mediante simulaciones de dinámica molecular y metadinámica utilizando ceefourin1 como inhibidor de referencia. Los resultados mostraron que los mejores candidatos de la biblioteca NPA actúan teóricamente como sustratos y no superan la afinidad del control, siendo descartados. Por el contrario, la estrategia de reposicionamiento identificó a imatinib (ΔG= -64.55 kcal/mol) y avatrombopag (ΔG= -60.81 kcal/mol) como los candidatos más prometedores, con afinidades teóricas superiores a ceefourin-1 (ΔG= -56.65 kcal/mol). El análisis de interacciones sugirió que residuos como Trp995, Phe368, His152 y Met992 son determinantes para la inhibición funcional de MRP4.

2026-06-30T00:00:00Z María Fernanda Herrera Zamorano https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/13040 2026-06-19T06:09:46Z 2026-06-17T00:00:00Z

Efecto de la desglucosilación de compuestos polifenólicos presentes en un extracto de garambullo sobre su carga en nanopartículas de sílice mesoporosa para su admistración oral María Fernanda Herrera Zamorano La carga de extractos vegetales, como el garambullo (Myrtillocactus geometrizans), en nanopartículas de sílice mesoporosa (NSM) constituye un método de interés para aumentar la biodisponibilidad de sus compuestos fenólicos (CP). Los CP glucosilados presentan una abundancia superior a los CP aglicona, sin embargo, estos últimos muestran mejor actividad biológica. No obstante, la ausencia de glucósidos puede modificar las interacciones químicas entre las NSM y los CP. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto de la desglicosilación sobre la eficiencia de encapsulación y de liberación de un extracto rico en CP obtenido del garambullo, empleando NSM como vehículo. Se aisló la fase orgánica de un extracto etanólico de garambullo y se sometió a un tratamiento ultrasónico para inducir la desglicosilación de sus CP. Posterior a su caracterización mediante métodos espectrofotométricos (UV-Vis y FT-IR) y a la obtención de su perfil fitoquímico (fenoles totales y flavonoides), los extractos se cargaron en NSM. Para las NSM cargadas se determinó su capacidad de carga, su capacidad antioxidante y se monitoreo su perfil de liberación en medio acuoso. El extracto de garambullo (EG) tratado con ultrasonido (EGU) mostró una mayor capacidad de carga en NSM (3.56 ± 0.02 %; p/p) comparado con el extracto sin tratar (0.58 ± 0.03; p/p). La capacidad antioxidante del EG fue superior a la del EGU, tanto por DPPH (0.65± 0.03 y 0.54 ± 0.07 mgET/g, respectivamente) como por ABTS (0.66 ± 0.02 y 0.51 ± 0.05 mgET/g, respectivamente), debido a la degradación de los CP por el tratamiento ultrasónico, sin embargo, al cargarse en NSM, ambos extractos incrementaron su capacidad antioxidante por DPPH (1.88 ± 0.01 y 1.71 ± 0.02 mgET/g, respectivamente y por ABTS (1.62 ± 0.08 y 1.10 ± 0.03 mgET/g, respectivamente). En medio acuoso, a pH 1.5 y 7.4, el EGU mostró una liberación menor, lo que indica una mayor interacción con la matriz. En conclusión, la desglicosilación de los CP del extracto vegetal incrementó su interacción con las NSM y su liberación controlada, lo que sugiere que las NSM cargadas con EGU constituyen un sistema de liberación potencialmente útil para la administración oral de los CP de garambullo.

2026-06-17T00:00:00Z