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Título : Estudio Computacional del canal de calcio dependiente de voltaje de tipo T (CACNA1G) y su interacción con anticonvulsivos.
Autor: Beatriz Hernández Estrada
Palabras clave : Biología y Química
Química
Química Farmacéutica
Fecha de publicación : 1-ago-2023
Editorial : Química
Facultad: Facultad de Química
Prográma académico: Maestría en Ciencias Químico Biológicas
Resumen: La epilepsia es una alteración del sistema nervioso central, que afecta aproximadamente 70 millones de personas a nivel mundial, siendo una de las enfermedades neurológicas más frecuentes. Actualmente, existen fármacos eficaces contra la sintomatología; sin embargo, ninguno de estos fármacos actúa contra los procesos neurobiológicos que contribuyen al desarrollo de la enfermedad. Los antiepilépticos, por lo general, no presentan un mecanismo de acción único y/o no están completamente descritos. El desarrollo de convulsiones se acompaña por un incremento de las corrientes de calcio de tipo T, debido a una expresión creciente del canal de Ca2+ CaV3.1 (CACNA1G). Por otra parte, las herramientas computacionales han favorecido el uso de los estudios in silico para el análisis de moléculas de interés biológico, por lo cual se ha convertido en parte integral de la investigación dirigida al diseño y descubrimiento de fármacos. Debido a la escasa información sobre el mecanismo de acción de los fármacos dirigidos a CACNA1G, en este trabajo se evaluó el modo de unión, modelado por homología, acoplamiento molecular, simulaciones de dinámica molecular y metadinámicas como umbrella sampling. Los resultados mostraron que los aminoácidos que parecen ser más relevantes para su actividad anticonvulsiva son Asp924, HIS497, TRP1483 y TRP1488, observados mediante acoplamiento y dinámica molecular. Una vez realizados los acoplamientos moleculares y validar la conformación y sitio de unión se realizó un cálculo de energía de unión de los fármacos específicos como lo son: flunarizina (-98.9 kcal/mol), el levetiracetam (-91.6 kcal/mol) y el cannabidiol (-74.39 kcal/mol), zonisamida (-29.7 kcal/mol), trimetadiona (-25.5 kcal/mol), etosuximida (-9.7 kcal/mol) y metosuximida (-9.7 kcal/mol), teniendo en cuenta como control positivo a z944 (-148.38 kcal/mol) y como controles negativos brivaracetam (-17.45 kcal/mol) y mefenitoína (-17.27 kcal/mol). Con estos datos podemos observar que los que flunarizina, levetiracetam y cannabidiol si presentan buenas energías de unión (considerando que a valores más negativos menos energía para unirse necesitan), mientras que, para el caso específico de trimetadiona, zonisamida, etosuximida y metosuximida presentan baja afinidad con respecto al control, lo que podría indicar que presentan un sitio de unión diferente.
URI : https://ri-ng.uaq.mx/handle/123456789/9056
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